El Colegio forma parte de la Comisión de Formación Intrercolegial, a través de la Fundación para la Agricultura del Conocimiento. Las funciones de la Comisión se deberán circunscribir al ámbito de la formación y de la información en los distintos ámbitos de interés de la profesión del Ingeniero Agrónomo, destacando entre ellas el proponer a la Junta de Gobierno el Plan de Formación anual así como realizar el seguimiento y evaluación del Plan de Formación en vigor. La comisión velará por la calidad de las acciones formativas.
La composición de la Comisión, según lo reglamentariamente establecido, será la siguiente: el Decano, que actuará como presidente, el Secretario Técnico, la Secretaria Adjunta, y los miembros de la Junta de Gobierno o colegiados que sean convocados a la misma para prestar el apoyo necesario.